Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECI1P42126 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECI1P42126 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms