Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms