Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms