Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms