Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD13P35453 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms