Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA4P35212 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJA4P35212 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GJA4P35212 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJA4P35212 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJA4P35212 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJA4P35212 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GJA4P35212 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJA4P35212 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms