Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYKP34925 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYKP34925 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYKP34925 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYKP34925 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYKP34925 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms