Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms