Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms