Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCAP28676 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCAP28676 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCAP28676 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCAP28676 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCAP28676 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCAP28676 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms