Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms