Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YY1P25490 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YY1P25490 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YY1P25490 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YY1P25490 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YY1P25490 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YY1P25490 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YY1P25490 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YY1P25490 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms