Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms