Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFAP15692 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VEGFAP15692 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms