Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPBP14678 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms