Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGB3P0DN86 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms