Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2BP0DI82 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms