Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4BP0C0L5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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