Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD4O95243 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD4O95243 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD4O95243 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD4O95243 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD4O95243 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD4O95243 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD4O95243 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD4O95243 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD4O95243 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms