Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNSO60931 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNSO60931 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNSO60931 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNSO60931 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNSO60931 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms