Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC9O60706 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC9O60706 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms