Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8AO60658 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms