Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC28A2O43868 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC28A2O43868 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms