Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms