Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFA2T2O43439 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBFA2T2O43439 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBFA2T2O43439 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms