Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COCHO43405 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COCHO43405 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COCHO43405 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COCHO43405 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COCHO43405 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COCHO43405 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COCHO43405 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms