Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC4O15439 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC4O15439 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCC4O15439 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms