Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM6BO15054 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM6BO15054 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
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