Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms