Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms