Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CCDC179H3BU77 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms