Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HMGB1P1B2RPK0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms