Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VGLL3A8MV65 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VGLL3A8MV65 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms