Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NOTOA8MTQ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms