Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD3A6NKT7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms