Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRCP1A6NGW2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRCP1A6NGW2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms