Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms