Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRT87PA6NCN2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT87PA6NCN2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms