Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC162PA2VCL2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms