Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC144AA2RUR9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC144AA2RUR9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC144AA2RUR9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC144AA2RUR9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms