Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms