Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN3Q9Y4C0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms