Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2J1Q9Y385 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms