Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms