Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms