Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms