Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms