Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHIC2Q9UKJ5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms