Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms