Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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